RodentFlow 是什么
RodentFlow 是一款用于啮齿类动物行为实验的 iPhone App，覆盖从一段实验录像到组间比较的全过程：
- 追踪：在俯拍视频中追踪单只动物，并把它在校准后的场地或迷宫里的位置换算成厘米。
- 打分：根据位置计算区域时间、进入次数、距离、潜伏期、僵直，以及各实验范式特有的指标。
- 汇总：每只动物、每个实验阶段生成一条结果。结果也可以来自手动评分的数值，或其他软件导出的表格。
- 比较：按实验设计自动选择统计检验，画出显示每只动物数据点的图，并导出图、统计结果和数据。
所有计算都在手机上完成：不需要账号，没有服务器，不上传任何数据。见隐私政策。
RodentFlow 以 MIT 许可证开源，App 源代码和本手册都公开在 github.com/seesaw-earth/RodentFlow，见开源与构建。
两个标签页
| 标签页 | 用途 |
|---|---|
| 实验 | 开始新实验：先选实验范式，再分析视频、录入数值或导入表格。结果卡片列出所有已保存的结果。 |
| 组间分析 | 选择实验范式和测量指标，设定实验设计，查看该范式全部结果的统计和图表。 |
三种数据来源
| 来源 | 适用情况 | 实验范式 |
|---|---|---|
| 视频追踪 | 有单只动物的俯拍录像 | 旷场、高架十字迷宫、明暗箱、Y 迷宫、T 迷宫、新物体识别、Morris 水迷宫、Barnes 迷宫、恐惧条件化、条件性位置偏好 |
| 手动录入 | 人工打分（秒表、计数、称重） | 全部 15 种 |
| 表格导入 | 数值来自电子表格或其他追踪软件（ANY-maze、EthoVision、DeepLabCut 后处理等） | 全部 15 种，外加任意自定义表格 |
三种来源生成的结果格式相同。同一范式下，视频、手动和导入的结果可以在组间分析中一起使用。
追踪器能测什么，不能测什么
RodentFlow 使用经典、透明的追踪方法：背景减除，然后取动物身体的质心。追踪原理逐步讲解了每一步。开始之前，最好先了解这个选择带来的几点影响：
- 每个场地一只动物。 每次分析只追踪校准区域内的一只动物。画面里如果并排拍了几个场地，可以逐个分析，每次校准其中一个。
- 身体中心，而不是鼻尖。 追踪点是身体中心。新物体探索和 Barnes 探洞这类通常按鼻尖打分的指标，用物体或洞口周围一个足够大的区域来近似。设置方法见各范式页面。
- 俯拍视角。 位置换算到地面平面上的厘米，前提是相机从上方往下拍。
- 不做姿态估计或行为分类。 不识别直立、理毛、嗅探。僵直是根据前后帧像素变化测量的，这也是自动测量僵直的标准做法。
如果需要追踪身体部位，或者同一场地里有多只互动的动物，深度学习姿态估计工具更合适，延伸阅读列出了近年的主要工具。它们输出的每只动物的数据可以再导入 RodentFlow 做统计。
系统要求
- iPhone，iOS 17 或更高版本。
- 英文或简体中文。App 跟随 iPhone 的系统语言。如果只想给 RodentFlow 换一种语言，点 Aa › Language / 语言，会打开 App 在“设置”里的页面。
- 文字大小：Aa 菜单提供从“小”到“最大”五档，或“跟随 iPhone”。