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实验范式 ​

RodentFlow 内置 15 种实验范式,外加一种自定义表格。对每种范式,App 都知道它的场地、阶段、区域和设置、各指标及其定义、天然的组内比较,以及有机会水平的指标的机会水平。本页是总览,四个分类页面给出细节。

实验范式类别视频追踪阶段主要指标
旷场 / 中央区焦虑与情绪矩形或圆形—总距离;中央区时间 %
高架十字迷宫焦虑与情绪十字迷宫—开放臂时间 %
明暗箱焦虑与情绪矩形—明箱时间 %
埋珠实验焦虑与情绪——掩埋玻璃珠 %
糖水偏好焦虑与情绪——糖水偏好 %
Y 迷宫学习与记忆Y 迷宫—自发交替率 %
T 迷宫学习与记忆T 迷宫—首选右侧 %
新物体识别学习与记忆矩形或圆形训练、测试辨别指数
Morris 水迷宫学习与记忆圆形习得、探索测试逃避潜伏期;目标象限 %
Barnes 迷宫学习与记忆圆形习得、探索测试初次潜伏期;目标象限 %
恐惧条件化学习与记忆矩形训练、情境测试、线索测试僵直 %;CS 期僵直 %
平衡木运动功能—平衡木(自由填写)通过时间
步态分析运动功能——后肢步长
条件性位置偏好奖赏与决策矩形前测、条件化、测试偏好分数
双臂老虎机任务奖赏与决策—场次 / 区组(自由填写)高价值选择 %
其他 / 自定义表格其他—自由填写任意导入的列

每种范式都可以手动录入或从表格导入(方法)。

各区域一览 ​

视频范式的区域

区域在校准后以场地厘米坐标定义,追踪后都可以在结果页修改。图中是默认值:中央区边长为场地边长的 50 %,明箱占箱体的 2/3,位置偏好设为三箱时中间箱占 20 %(默认为两箱,在 50 % 处分隔),物体半径 8 cm,平台半径 6 cm,贴壁区 10 cm,Barnes 迷宫 20 个洞。

所有视频范式共用的规则 ​

详细解释见从位置到指标。

  • 采样:每秒采样 10 次,每个样本代表到下一个样本之前的时间。
  • 区域时间只统计检测到动物的样本。区域时间百分比以检测到动物的时间为分母,除非另有说明。
  • 进入某个区域,要在该区域停留满进入标准才计数:默认 0.3 s;十字迷宫、T 迷宫和 Y 迷宫为 0.25 s;明暗箱和位置偏好为 0.5 s;Barnes 迷宫为 0.2 s。分析开始时动物已经在某个区域里,不算一次进入。
  • 潜伏期是从分析窗口开始到第一次进入的时间。如果始终未进入,记为窗口长度;如果一开始就在该区域内,记为 0。
  • 距离是相邻两个“检测到”的样本之间步长的总和,检测中断的时段不增加距离。
  • 分析窗口(起始于、长度)把所有指标限制在视频的一部分,例如前 5 分钟。
  • 追踪成功样本 % 是找到动物的样本比例,低于 90 % 时结果会带有质量提示。明暗箱、恐惧条件化和 Barnes 迷宫例外,因为这些范式中动物本来就会有时看不见。